14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0773 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0773  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  303  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2804  hypothetical protein  51 
 
 
151 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28320  hypothetical protein  44.12 
 
 
131 aa  79  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1967  hypothetical protein  34.29 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000966023  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4613  hypothetical protein  31.93 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.787704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4824  hypothetical protein  31.34 
 
 
144 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139934  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1909  hypothetical protein  30.91 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409563  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5920  hypothetical protein  30.58 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0697  hypothetical protein  35.56 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.756425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0396  hypothetical protein  44.44 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38532  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2616  hypothetical protein  29.51 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2577  hypothetical protein  29.51 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2622  hypothetical protein  29.51 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0727892  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3471  hypothetical protein  30.69 
 
 
103 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>