16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0165 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0165  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  357  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0544  hypothetical protein  31.72 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  29.23 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1709  hypothetical protein  27.72 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2486  hypothetical protein  27.57 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0273408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0328  hypothetical protein  26.94 
 
 		 289 aa  51.2  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1465  hypothetical protein  32.39 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4760  hypothetical protein  32.73 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.785775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5306  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0426  hypothetical protein  26.98 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125949  hitchhiker  0.0000334915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0233  hypothetical protein  29.41 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5443  hypothetical protein  29.28 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5419  hypothetical protein  29.28 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257905  normal  0.0113948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4850  hypothetical protein  29.28 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2655  hypothetical protein  25.14 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00248341  unclonable  0.0000000268429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1063  hypothetical protein  24.73 
 
 		 188 aa  42  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0325013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>