35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1129 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1129  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  353  7.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  81.07 
 
 		 169 aa  301  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2563  hypothetical protein  67.46 
 
 		 169 aa  259  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00285487  hitchhiker  0.0000000213199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  57.93 
 
 		 166 aa  200  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  53.33 
 
 		 174 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  46.71 
 
 		 171 aa  164  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  46.06 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  30.26 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  31.76 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  28.03 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  30.41 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  27.52 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  29.58 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  30.34 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  28 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  29.61 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  27.52 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  26.35 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  27.08 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  26.71 
 
 		 146 aa  47.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  27.4 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  25.81 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  25.34 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  30.12 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  25.62 
 
 		 154 aa  44.3  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  25.17 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  25.17 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  25.69 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  25.69 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  25.55 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  26 
 
 		 147 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  26.67 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  25 
 
 		 194 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>