21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1711 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1711  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  306  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000195986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1047  hypothetical protein  52.94 
 
 
156 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1184  hypothetical protein  50.66 
 
 
156 aa  148  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0282  hypothetical protein  49.02 
 
 
156 aa  144  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1236  hypothetical protein  51.33 
 
 
156 aa  141  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2830  HAD family hydrolase  46.05 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0830  soluble P-type ATPase  45.75 
 
 
156 aa  136  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1112  hypothetical protein  45.39 
 
 
156 aa  134  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00144751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2299  hypothetical protein  47.33 
 
 
156 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0021594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0593  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0027  hypothetical protein  45.1 
 
 
156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1180  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0424  hypothetical protein  49.66 
 
 
160 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25270  soluble P-type ATPase  42.21 
 
 
154 aa  124  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0968329 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0477  HAD family hydrolase  38.96 
 
 
149 aa  103  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0341937  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1135  hypothetical protein  41.72 
 
 
155 aa  103  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0725  HAD family hydrolase  33.77 
 
 
149 aa  97.1  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1442  HAD family hydrolase  40 
 
 
131 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0360  hypothetical protein  38.64 
 
 
127 aa  87.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.171021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0545  HAD family hydrolase  38.98 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0908352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2536  copper-exporting ATPase  27.69 
 
 
795 aa  40.8  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>