14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1418 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1418  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  909    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3242  hypothetical protein  52.96 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6291  hypothetical protein  33.88 
 
 
425 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20510  hypothetical protein  39.34 
 
 
295 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5348  hypothetical protein  31.56 
 
 
366 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1057  hypothetical protein  26.67 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3160  hypothetical protein  50.82 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1186  hypothetical protein  41.18 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6294  hypothetical protein  28.35 
 
 
455 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1789  hypothetical protein  44.07 
 
 
424 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0235  hypothetical protein  43.08 
 
 
395 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5084  hypothetical protein  42.86 
 
 
229 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000765562  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2360  hypothetical protein  40 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5498  hypothetical protein  21.02 
 
 
485 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0138442  normal  0.0382581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>