38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0617 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 528 aa  1082    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  57.84 
 
 		 562 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  57.45 
 
 		 527 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  56.92 
 
 		 530 aa  578  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  59.45 
 
 		 539 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  34.65 
 
 		 514 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  34.65 
 
 		 514 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  31.11 
 
 		 507 aa  236  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  31.76 
 
 		 514 aa  236  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  29.76 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  33.2 
 
 		 509 aa  230  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  31.67 
 
 		 521 aa  229  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  30.67 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  29.82 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  30.67 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  29.88 
 
 		 502 aa  227  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  30.75 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  29.53 
 
 		 507 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  29.63 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  29.05 
 
 		 496 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  29.35 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  29.46 
 
 		 507 aa  199  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  28.8 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  27.61 
 
 		 497 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  28.66 
 
 		 508 aa  196  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  28.92 
 
 		 495 aa  193  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  28.15 
 
 		 510 aa  193  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  27.04 
 
 		 494 aa  192  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  28.92 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  29.37 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  28.15 
 
 		 500 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  25.49 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  29.16 
 
 		 522 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  27.54 
 
 		 528 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  22.68 
 
 		 559 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  25.74 
 
 		 586 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  26.59 
 
 		 417 aa  53.5  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  21.25 
 
 		 557 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>