28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3359 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  100 
 
 		 323 aa  630  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  53.77 
 
 		 339 aa  292  7e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  44.44 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  40.59 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  37.79 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  35.2 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  34.35 
 
 		 456 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  34.29 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  34.29 
 
 		 369 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  33.87 
 
 		 361 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  35.35 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  35.95 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  30.03 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  36.8 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  34.35 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  39.52 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  33.92 
 
 		 319 aa  89.4  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  33.92 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  34.07 
 
 		 779 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.65 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  31.56 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  37.62 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.46 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  25.68 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  25.17 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  34.55 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  28.18 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>