20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2734 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2734    100 
 
 
1974 bp  3913    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0716494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3355    99.92 
 
 
2247 bp  2327    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.013502  normal  0.394896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2595    96.6 
 
 
3459 bp  2018    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195875  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  89.47 
 
 
684 bp  65.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0604    87.27 
 
 
1752 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5115    87.27 
 
 
3897 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  87.27 
 
 
801 bp  54  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>