16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2578 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  25.16 
 
 
322 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  29.94 
 
 
343 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  35.88 
 
 
466 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  44.19 
 
 
347 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  24.43 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  31.93 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  38.95 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  40.91 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  26.42 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  35.24 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  35.34 
 
 
354 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  22.38 
 
 
428 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  28.72 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  27.17 
 
 
229 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  30.17 
 
 
233 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>