31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1038 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1038  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  187  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0983054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7428  hypothetical protein  67.39 
 
 
92 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0968962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3343  hypothetical protein  65.91 
 
 
92 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1486  hypothetical protein  63.04 
 
 
95 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3913  hypothetical protein  60.87 
 
 
92 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2328  hypothetical protein  63.1 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1980  hypothetical protein  61.63 
 
 
90 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3549  hypothetical protein  65.43 
 
 
99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.242285  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0129  hypothetical protein  64.47 
 
 
87 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280117  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3367  hypothetical protein  63.16 
 
 
87 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0367  hypothetical protein  54.76 
 
 
87 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0844  hypothetical protein  59.21 
 
 
88 aa  90.5  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1811  hypothetical protein  51.11 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465355  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0762  hypothetical protein  51.72 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3180  hypothetical protein  52.63 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0603995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2865  hypothetical protein  51.72 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.064843  normal  0.0210484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3680  hypothetical protein  57.89 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3072  hypothetical protein  51.9 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288169  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0713  hypothetical protein  50.6 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39863  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3813  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2794  hypothetical protein  50.63 
 
 
87 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.617961  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1208  hypothetical protein  52.44 
 
 
86 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3527  hypothetical protein  52.44 
 
 
86 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239043  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0527  hypothetical protein  54.17 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.631272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7726  hypothetical protein  48.68 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0513086  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3019  hypothetical protein  46.05 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3172  hypothetical protein  47.44 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3836  hypothetical protein  43.9 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.071209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4018  hypothetical protein  48.72 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835397  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0578  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0767023  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1516  hypothetical protein  41.77 
 
 
87 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.184159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>