29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0449 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0449  Domain of unknown function DUF1849  100 
 
 
281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0157  hypothetical protein  37.93 
 
 
275 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2069  hypothetical protein  33.47 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6683  hypothetical protein  30.71 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1791  hypothetical protein  32.32 
 
 
302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.294448  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7421  hypothetical protein  31.46 
 
 
284 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5259  protein of unknown function DUF1849  29.92 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245499  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4720  hypothetical protein  29.8 
 
 
288 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5187  hypothetical protein  29.8 
 
 
288 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2028  hypothetical protein  26.69 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0094929  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1124  hypothetical protein  28.79 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1346  hypothetical protein  29.18 
 
 
302 aa  89.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1121  hypothetical protein  27.12 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.619187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1164  hypothetical protein  27.12 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2808  hypothetical protein  28.4 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  0.727732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1867  hypothetical protein  30.04 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3794  hypothetical protein  26.47 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2446  hypothetical protein  28.25 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3312  hypothetical protein  27.61 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0618924  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3042  hypothetical protein  27.03 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2409  hypothetical protein  27.66 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3545  hypothetical protein  27.01 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2529  hypothetical protein  28.36 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1428  hypothetical protein  24.83 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1578  hypothetical protein  28.03 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767865  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1775  hypothetical protein  27.62 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4750  hypothetical protein  27 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.838034 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0582  hypothetical protein  25.29 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1380  hypothetical protein  24.44 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>