16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4842 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4842  hypothetical protein  100 
 
 		 905 aa  1727    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  40.61 
 
 		 831 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  36.28 
 
 		 811 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  38.17 
 
 		 809 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  38.17 
 
 		 809 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  38.17 
 
 		 809 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  35.82 
 
 		 802 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  38.05 
 
 		 804 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  30.05 
 
 		 764 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  30.46 
 
 		 706 aa  125  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  29.47 
 
 		 873 aa  103  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  27.54 
 
 		 784 aa  67.8  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  25 
 
 		 870 aa  55.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  26.24 
 
 		 820 aa  51.2  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  35.14 
 
 		 814 aa  48.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  22.86 
 
 		 713 aa  47.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>