14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4428 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4428  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  738    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4444  hypothetical protein  99.45 
 
 		 363 aa  708    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1118  hypothetical protein  48.98 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0643  hypothetical protein  41.64 
 
 		 550 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.24252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28850  hypothetical protein  31 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3460  hypothetical protein  31.55 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04420  hypothetical protein  28.82 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31820  hypothetical protein  29.27 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2199  hypothetical protein  25.42 
 
 		 369 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07200  hypothetical protein  26.32 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287125  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1302  hypothetical protein  24.24 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2887  hypothetical protein  24.3 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.286834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4332  hypothetical protein  31.3 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1137  hypothetical protein  26.1 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>