13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4290 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4290  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 		 144 aa  296  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.730002  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2810  hypothetical protein  44.44 
 
 		 406 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3151  hypothetical protein  48.23 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0404709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3027  hypothetical protein  47.14 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.817647  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3086  hypothetical protein  47.14 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0608986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3377  hypothetical protein  47.52 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3043  hypothetical protein  47.14 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126075  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1760  hypothetical protein  44.06 
 
 		 187 aa  120  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2441  hypothetical protein  45.07 
 
 		 166 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000563318  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3628  hypothetical protein  47.41 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3109  hypothetical protein  42.36 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.793983  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20140  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  40.88 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419152  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0938  Polyketide cyclase/dehydrase  31.85 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0314793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>