14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3893 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3893  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1132  hypothetical protein  52.59 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0544737  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5604  hypothetical protein  44.06 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0168557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3295  hypothetical protein  35.37 
 
 		 192 aa  94.4  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1749  hypothetical protein  35.76 
 
 		 167 aa  94  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.766751  hitchhiker  0.00905624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0447  hypothetical protein  38.1 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2398  hypothetical protein  37.65 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000409685  decreased coverage  0.000121837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2969  hypothetical protein  29.49 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1389  hypothetical protein  36.31 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.400134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3036  hypothetical protein  34.97 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1099  hypothetical protein  31.82 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3177  hypothetical protein  40.74 
 
 		 69 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>