28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2908 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2908  Sucraseferredoxin family protein  100 
 
 
294 aa  589  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5631  sucraseferredoxin family protein  65.64 
 
 
295 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5251  sucraseferredoxin-like protein  65.29 
 
 
295 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5340  sucraseferredoxin family protein  65.29 
 
 
295 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.901473  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0338  sucraseferredoxin family protein  62.24 
 
 
300 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248903  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3280  Sucraseferredoxin family protein  43.8 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3065  Sucraseferredoxin family protein  37.93 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000185478  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4377  sucraseferredoxin family protein  40.26 
 
 
303 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0587956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1340  Sucraseferredoxin family protein  37.91 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421578  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13820  uncharacterized conserved protein with thioredoxin-like domain  36.08 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2240  sucraseferredoxin family protein  36.84 
 
 
301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02490  uncharacterized conserved protein with thioredoxin-like domain  34.33 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6685  hypothetical protein  34.65 
 
 
312 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5270  Sucraseferredoxin family protein  36.17 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1766  Sucraseferredoxin family protein  33.46 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4380  sucraseferredoxin family protein  33.46 
 
 
284 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0955  Sucraseferredoxin family protein  35.81 
 
 
313 aa  92.4  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.886609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1795  Sucraseferredoxin family protein  40 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8095  Sucraseferredoxin family protein  34.52 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1040  sucraseferredoxin-like protein  29.49 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3033  sucraseferredoxin-like  24.27 
 
 
335 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.262955  hitchhiker  0.00219158 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5760  Sucraseferredoxin family protein  25.82 
 
 
340 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1568  sucraseferredoxin family protein  27.78 
 
 
327 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4480  sucraseferredoxin family protein  31.3 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4698  sucraseferredoxin family protein  29.24 
 
 
333 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4340  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2831  hypothetical protein  21.94 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2755  sucraseferredoxin-like  25 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>