27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1961 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1961  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3852  hypothetical protein  53.93 
 
 		 195 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3926  hypothetical protein  53.93 
 
 		 195 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3838  hypothetical protein  53.93 
 
 		 195 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0721345  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2350  hypothetical protein  54.97 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.394519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29220  protein of unknown function (DUF2017)  51.58 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.942758  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4295  hypothetical protein  54.97 
 
 		 194 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11364  transcriptional regulator  51.53 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000273911  normal  0.357351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1006  hypothetical protein  48.69 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1288  Domain of unknown function DUF2017  50.76 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1695  hypothetical protein  42.35 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185996  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  40.11 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  34.59 
 
 		 174 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  35.87 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1724  hypothetical protein  34.2 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  33.85 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  29.69 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1354  Domain of unknown function DUF2017  34.01 
 
 		 165 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  34.6 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  35.06 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  28.88 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0865  hypothetical protein  31.98 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1870  hypothetical protein  41.1 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087636  normal  0.127946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  30.37 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  32.65 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  32.59 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>