24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0256 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0256  DoxX family protein  100 
 
 
448 aa  899    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5342  hypothetical protein  29.32 
 
 
426 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0868  hypothetical protein  31.21 
 
 
459 aa  153  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4334  hypothetical protein  28.51 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0558  hypothetical protein  27.51 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.675961 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0552  hypothetical protein  33.6 
 
 
504 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.677753  normal  0.24778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0337  hypothetical protein  33.87 
 
 
448 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0551  hypothetical protein  29.32 
 
 
501 aa  122  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0548  hypothetical protein  28.52 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2081  hypothetical protein  32.81 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.252224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0336  hypothetical protein  30.2 
 
 
492 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0136782  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2732  hypothetical protein  32.01 
 
 
449 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  hitchhiker  0.00119476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0555  hypothetical protein  30.31 
 
 
442 aa  110  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.589483  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2733  hypothetical protein  29.7 
 
 
570 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  hitchhiker  0.00174807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1617  hypothetical protein  28.8 
 
 
579 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0549  hypothetical protein  28.29 
 
 
542 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0550  hypothetical protein  26.25 
 
 
523 aa  97.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1618  hypothetical protein  29.06 
 
 
475 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.483238  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06020  hypothetical protein  41.04 
 
 
353 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.305074  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0556  hypothetical protein  25.99 
 
 
515 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.253273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2083  hypothetical protein  25.75 
 
 
493 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  0.196729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0557  hypothetical protein  26.22 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2082  hypothetical protein  26.88 
 
 
476 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  0.181535 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02555  hypothetical protein  35.29 
 
 
239 aa  43.1  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>