70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2547 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  97.93 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  57.53 
 
 		 146 aa  179  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  52.7 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.59 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  50 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  46.98 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  48.2 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  41.84 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  44.2 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  40.97 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  33.8 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  35.21 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  33.57 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  34.27 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  34.51 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  32.39 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  32.43 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  31.54 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  31.65 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  32.43 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  35.96 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  32.61 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  26.71 
 
 		 182 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  31.72 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  32.17 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  29.93 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  29.84 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  33.61 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  29.71 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  29.14 
 
 		 194 aa  70.1  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  33.63 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  32.46 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  29.91 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  30.83 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  29.66 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  31.93 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  31.08 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  30.41 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  32.37 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  32.17 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  28.69 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  31.65 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  29.06 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  27.64 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  28.15 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  29.57 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  28.37 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1077  hypothetical protein  29.92 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  25.2 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  24.59 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  26.76 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  27.83 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  31.58 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  24.8 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  27.05 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  30.07 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  27.73 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  26.83 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  27.78 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  25.2 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  26.89 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  27.73 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  28.7 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  30.25 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>