15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0530 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0530  protein of unknown function DUF922  100 
 
 		 209 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0183293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0542  protein of unknown function DUF922  88.52 
 
 		 209 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  28.4 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3701  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2245  hypothetical protein  23.96 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1411  hypothetical protein  23.43 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  27.11 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0920  hypothetical protein  27.27 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  25.9 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0206  secreted Zn-dependent protease-like protein  26.11 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5905  hypothetical protein  26.4 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0994  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  26.32 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2114  hypothetical protein  24.87 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4432  hypothetical protein  26.22 
 
 		 199 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>