41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0825 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0825  protein of unknown function DUF350  100 
 
 
141 aa  285  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2631  protein of unknown function DUF350  85.19 
 
 
135 aa  239  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.155004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1314  hypothetical protein  42.61 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00268804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3705  hypothetical protein  37.72 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00316212  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1751  hypothetical protein  36.84 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000355487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1502  hypothetical protein  36.84 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.828357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1640  hypothetical protein  36.84 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1459  hypothetical protein  36.84 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1673  hypothetical protein  37 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1487  hypothetical protein  37 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1460  hypothetical protein  37 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1603  hypothetical protein  37 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1785  protein of unknown function DUF350  37.86 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3753  hypothetical protein  28.95 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1221  hypothetical protein  31.03 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4714  putative inner membrane protein  23.64 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3303  hypothetical protein  26 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4651  inner membrane protein YjfL  25.71 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02188  hypothetical protein  28.12 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3809  protein of unknown function DUF350  22.73 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04013  hypothetical protein  22.73 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5700  putative inner membrane protein  22.73 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04051  conserved inner membrane protein  22.73 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4428  putative inner membrane protein  22.73 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4655  putative inner membrane protein  22.73 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.698141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3829  hypothetical protein  22.73 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4744  putative inner membrane protein  22.73 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5549  protein of unknown function DUF350  29.2 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.848106 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4735  inner membrane protein YjfL  24.76 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482474  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4792  hypothetical protein  24.76 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4771  inner membrane protein YjfL  24.76 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.888513  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5201  protein of unknown function DUF350  29.47 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4660  hypothetical protein  28.42 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5123  protein of unknown function DUF350  28.42 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331318  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4642  inner membrane protein YjfL  23.81 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3442  hypothetical protein  24.77 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280161  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5394  hypothetical protein  26.6 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.593541  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4892  hypothetical protein  26.6 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487798  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3474  hypothetical protein  26.6 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3599  protein of unknown function DUF350  24.77 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5046  hypothetical protein  33.64 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0178829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>