18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3347 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3347  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3456  XapX domain protein  83.64 
 
 
55 aa  95.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2357  hypothetical protein  56 
 
 
56 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.231966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18070  hypothetical protein  56 
 
 
51 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0618  hypothetical protein  52 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1776  hypothetical protein  57.14 
 
 
59 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3182  hypothetical protein  58.14 
 
 
54 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0053  hypothetical protein  51.16 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000391068  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1387  hypothetical protein  43.14 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529463  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1667  hypothetical protein  53.33 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301712  normal  0.797723 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3130  XapX domain protein  45.83 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.322384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2613  hypothetical protein  48.08 
 
 
52 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265941  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2564  putative XapX domain  48.08 
 
 
52 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000167991  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2785  hypothetical protein  48.08 
 
 
52 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00694243  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2655  putative XapX domain  48.08 
 
 
52 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000295271  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2679  putative XapX domain  48.08 
 
 
52 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185519  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2559  hypothetical protein  44.9 
 
 
52 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000873429  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1257  conserved hypothetical protein  44.9 
 
 
52 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>