14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1500 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1500  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1660  hypothetical protein  62.03 
 
 
296 aa  351  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2090  hypothetical protein  61.6 
 
 
288 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1639  hypothetical protein  57.85 
 
 
287 aa  318  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2587  hypothetical protein  57.95 
 
 
288 aa  315  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1402  hypothetical protein  43.14 
 
 
289 aa  211  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.350794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2673  hypothetical protein  30.89 
 
 
290 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2140  hypothetical protein  31.58 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000054916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0679  hypothetical protein  30.57 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227554  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0668  hypothetical protein  25 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0668  hypothetical protein  26.99 
 
 
306 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0634  hypothetical protein  26.99 
 
 
306 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1573  hypothetical protein  22.35 
 
 
336 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.209685  normal  0.0518858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  33.33 
 
 
121 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>