83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0979 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  44.6 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  43.06 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  40.71 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  47.48 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  41.13 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  43.54 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  41.13 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  39.39 
 
 		 141 aa  103  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  33.99 
 
 		 172 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  41.3 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  38.64 
 
 		 179 aa  97.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  33.33 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  33.8 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  37.68 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  37.04 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  37.41 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  37.41 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  38.1 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  38.41 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  35.51 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  32.43 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  34.75 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  36.5 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  32.89 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  33.1 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  35.97 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  31.25 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  33.33 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  33.57 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  36.03 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  31.88 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  35.66 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  33.09 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  37.61 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  33.61 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  31.11 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  33.61 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  34.71 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  28.68 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  29.85 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  31.97 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  31.97 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  31.16 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  28.85 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  32.39 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  30.5 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  28.68 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  30.92 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  28.85 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  26.28 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.66 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  31.16 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  31.16 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  29.93 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  26.95 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  28.17 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  25.87 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  28.39 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  29.86 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  31.43 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  28.17 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  30.14 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  26.57 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  25.33 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  29.75 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  26.9 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  27.21 
 
 		 174 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  27.86 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  28.77 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  26.12 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3649  hypothetical protein  27.21 
 
 		 310 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  27.39 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  26.55 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1129  hypothetical protein  25.34 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>