24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3654 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  100 
 
 		 250 aa  510  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  54.42 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1301  baseplate assembly protein, putative  58.6 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120428 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  30.13 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  27.5 
 
 		 567 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  27.21 
 
 		 551 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  25.99 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  27.05 
 
 		 567 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  27.08 
 
 		 567 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  24.4 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  26.09 
 
 		 565 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  26.92 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  22 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  24.85 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  25.45 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  34.44 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  23.23 
 
 		 541 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  25.97 
 
 		 364 aa  48.9  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  25.64 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  25.64 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2250  bacteriophage Mu Gp45 protein  49.02 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4479  bacteriophage Mu Gp45 protein  49.02 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2253  bacteriophage Mu Gp45 protein  49.02 
 
 		 177 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000590369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1872  phage baseplate assembly protein V  40.51 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>