14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0542 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0542  protein of unknown function DUF922  100 
 
 		 209 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0530  protein of unknown function DUF922  88.52 
 
 		 209 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0183293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  26.95 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3701  hypothetical protein  25.3 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0206  secreted Zn-dependent protease-like protein  26.11 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2245  hypothetical protein  22.45 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  26.32 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0994  hypothetical protein  27.72 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0920  hypothetical protein  26.14 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  24.5 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  26.97 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2114  hypothetical protein  25.4 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1411  hypothetical protein  22.64 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2684  protein of unknown function DUF922  24.71 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0966382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>