19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7323 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  100 
 
 
919 aa  1781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  49.61 
 
 
884 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  28.61 
 
 
706 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  27.27 
 
 
835 aa  140  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  27.79 
 
 
814 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  26.6 
 
 
713 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  26.94 
 
 
764 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  29.67 
 
 
820 aa  104  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  27.32 
 
 
870 aa  102  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  27.66 
 
 
784 aa  87  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  25.38 
 
 
873 aa  85.1  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  28.22 
 
 
751 aa  77  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  25.14 
 
 
706 aa  69.7  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  33.33 
 
 
831 aa  57  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  26.24 
 
 
717 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  25.6 
 
 
811 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  25.57 
 
 
703 aa  52.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  31.67 
 
 
2851 aa  52.4  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  25.38 
 
 
820 aa  49.7  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>