13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6800 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6800  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  964    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3986  hypothetical protein  58.11 
 
 		 498 aa  471  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130499  normal  0.343534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4771  hypothetical protein  40 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1447  hypothetical protein  33.27 
 
 		 535 aa  223  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.124723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1296  hypothetical protein  33.58 
 
 		 528 aa  223  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01569  hypothetical protein  32.59 
 
 		 530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4637  hypothetical protein  24.83 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2690  hypothetical protein  23.23 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192027  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2539  hypothetical protein  23.61 
 
 		 405 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1171  hypothetical protein  36.71 
 
 		 299 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3583  hypothetical protein  25.41 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.424709 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12228  hypothetical protein  23.85 
 
 		 230 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5544  hypothetical protein  24.74 
 
 		 338 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.244919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>