20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6754 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 358 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  67.86 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  47.84 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  45.36 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  47.78 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  46.72 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  44.41 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  44.56 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  49.53 
 
 		 412 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  65.14 
 
 		 242 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  47.18 
 
 		 420 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  47.07 
 
 		 408 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  44.71 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  39.51 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  36.1 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  42.54 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  30.91 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  29.82 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  27.31 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  21.25 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>