14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6669 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6669  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  931    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00124083  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3759  hypothetical protein  26.27 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1247  hypothetical protein  24.09 
 
 
560 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.477424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2547  hypothetical protein  32.65 
 
 
627 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1597  hypothetical protein  28.81 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0611  hypothetical protein  27.03 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0811954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4849  hypothetical protein  25.15 
 
 
414 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6603  hypothetical protein  23.29 
 
 
338 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5988  hypothetical protein  25.41 
 
 
475 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075136  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0093  hypothetical protein  20.11 
 
 
361 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3719  hypothetical protein  25.93 
 
 
483 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0720  hypothetical protein  21.43 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0592  hypothetical protein  23.57 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.60475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1604  hypothetical protein  24.5 
 
 
452 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>