32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5655 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  328  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0865  hypothetical protein  83.43 
 
 
184 aa  261  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  43.33 
 
 
175 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  40.62 
 
 
182 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  43.28 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  38.42 
 
 
174 aa  91.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1724  hypothetical protein  37.64 
 
 
174 aa  87.8  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3852  hypothetical protein  35.16 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3838  hypothetical protein  35.16 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0721345  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3926  hypothetical protein  35.16 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29220  protein of unknown function (DUF2017)  34.39 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.942758  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1695  hypothetical protein  36.81 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185996  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  32.29 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  36.94 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  35.71 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  40.32 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  35.16 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  40.32 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  32.12 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1006  hypothetical protein  31.05 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1870  hypothetical protein  34.95 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087636  normal  0.127946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4295  hypothetical protein  34.38 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1961  hypothetical protein  32.14 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  41.18 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  33.52 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2350  hypothetical protein  32.68 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.394519  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1288  Domain of unknown function DUF2017  37.57 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1354  Domain of unknown function DUF2017  38.14 
 
 
165 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11364  transcriptional regulator  32.24 
 
 
218 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000273911  normal  0.357351 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08340  hypothetical protein  35.2 
 
 
255 aa  49.3  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1057  hypothetical protein  35.04 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20080  protein of unknown function (DUF2017)  32.34 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0919227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>