14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5630 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5630  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  265  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0916  hypothetical protein  67.65 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.398977  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1750  hypothetical protein  71.43 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0556  hypothetical protein  40.74 
 
 
227 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0346  hypothetical protein  32.58 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1320  hypothetical protein  39.76 
 
 
222 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0808  hypothetical protein  29.79 
 
 
260 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0050  hypothetical protein  35.19 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0560  hypothetical protein  35.19 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28950  hypothetical protein  40.74 
 
 
73 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.375135 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12541  hypothetical protein  42 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000783221  hitchhiker  0.002948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1029  hypothetical protein  41.82 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2072  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.72 
 
 
170 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3860  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  40  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>