16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5394 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  65.96 
 
 
287 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1065  hypothetical protein  60.34 
 
 
289 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390948  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2065  hypothetical protein  63.08 
 
 
280 aa  348  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.379601  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  63.44 
 
 
280 aa  346  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  59.72 
 
 
289 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2883  hypothetical protein  46.64 
 
 
310 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  42.52 
 
 
293 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  42.29 
 
 
298 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  32.58 
 
 
259 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  31.82 
 
 
259 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  32.2 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43168  predicted protein  28.29 
 
 
282 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  25.42 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1260  hypothetical protein  24 
 
 
266 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0689  hypothetical protein  27.59 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>