50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3820 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  41.18 
 
 		 144 aa  114  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  39.69 
 
 		 141 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  41.54 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  39.44 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  38.69 
 
 		 145 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  96.7  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  36 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  31.06 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  30.99 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  34.87 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  30.83 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  30.83 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  32.06 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  27.01 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  31.85 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  26.06 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  31.2 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  27.97 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  25.83 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  27.97 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  25 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  28.19 
 
 		 150 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  24.82 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  25.18 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1077  hypothetical protein  29.53 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  26.06 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  24.46 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  25 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  24.11 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  25.74 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.33 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  23.57 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  29.41 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  22.46 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  23.53 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  27.05 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  20.59 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  25 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  22.14 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  19.42 
 
 		 142 aa  45.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  22.38 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  23.57 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  21.33 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  26.19 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  22.31 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  23.24 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>