74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3817 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  100 
 
 
146 aa  294  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  44.44 
 
 
147 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  40.71 
 
 
147 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  41.84 
 
 
146 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  46.09 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  43.31 
 
 
146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  39.72 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  39.31 
 
 
150 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  37.14 
 
 
145 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  32.62 
 
 
147 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  36.42 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  34.69 
 
 
149 aa  95.9  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  35.86 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  36.88 
 
 
141 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  39.01 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  34.48 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  33.81 
 
 
147 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  33.33 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  35.77 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  32.89 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  35.04 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  31.43 
 
 
179 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  34 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  35.33 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  32.87 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  32.87 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  35.17 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  33.57 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  33.57 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  33.59 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  33.81 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  32.8 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  33.09 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  36.11 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  29.66 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  25.53 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  26.97 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  30.34 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  30.5 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  31.15 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  29.79 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  32.84 
 
 
182 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  30.14 
 
 
146 aa  60.1  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  33.87 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  32.09 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  31.25 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  29.45 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  32.81 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  29.05 
 
 
174 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  28.87 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  26.85 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  32.17 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  27.45 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  34.78 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  28.86 
 
 
176 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  27.4 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  27.64 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  32.86 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  31.15 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  24.66 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  29.25 
 
 
166 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3649  hypothetical protein  30 
 
 
310 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  32.28 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  25 
 
 
194 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  27.07 
 
 
150 aa  43.9  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  27.42 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.7 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2563  hypothetical protein  24.32 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00285487  hitchhiker  0.0000000213199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  30.25 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  26.71 
 
 
169 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  25.18 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0932  hypothetical protein  24.82 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0644252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1888  hypothetical protein  24.82 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0320965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3816  hypothetical protein  24.82 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>