21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2800 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 
399 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  46.91 
 
 
405 aa  297  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  46.61 
 
 
381 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  46.51 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  46.72 
 
 
358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  42.5 
 
 
436 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  45.95 
 
 
390 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  40.6 
 
 
367 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  46.04 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  44.21 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  41.82 
 
 
408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  46.89 
 
 
412 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  40.54 
 
 
242 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  45.64 
 
 
427 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  38.68 
 
 
409 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  34.08 
 
 
409 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  33.48 
 
 
491 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  28.99 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  27.49 
 
 
466 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  30.38 
 
 
385 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  21.64 
 
 
409 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0882102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>