15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2642 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2642  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  233  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06650  hypothetical protein  51.06 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1981  hypothetical protein  50.88 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.510264  normal  0.259293 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4340  hypothetical protein  44.74 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2201  hypothetical protein  44.74 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0039  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2907  hypothetical protein  51.06 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2599  hypothetical protein  42.48 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2643  hypothetical protein  42.48 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0926652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4582  hypothetical protein  43.4 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.804527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0385  hypothetical protein  68.85 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0475  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5942  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0581  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3446  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.256834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>