39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1772 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1772  putative integral membrane protein  100 
 
 		 336 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3140  hypothetical protein  56.85 
 
 		 288 aa  316  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2632  hypothetical protein  42.72 
 
 		 226 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3330  hypothetical protein  46.63 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0172089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3566  hypothetical protein  47.12 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3100  hypothetical protein  40.18 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.274656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07520  hypothetical protein  43.12 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.40957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0938  putative integral membrane protein  40.18 
 
 		 241 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0925  hypothetical protein  39.57 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4894  hypothetical protein  36.77 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3371  hypothetical protein  37.05 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1918  hypothetical protein  39.46 
 
 		 252 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00709075  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2931  hypothetical protein  37.98 
 
 		 243 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3583  hypothetical protein  37.98 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal  0.0522713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1265  hypothetical protein  39.17 
 
 		 228 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117366  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3328  hypothetical protein  39.15 
 
 		 250 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0819356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3317  hypothetical protein  39.15 
 
 		 250 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7408  integral membrane protein  40.24 
 
 		 242 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3379  hypothetical protein  39.15 
 
 		 250 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286158  normal  0.154521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0927  hypothetical protein  40.11 
 
 		 242 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2298  hypothetical protein  37.73 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1512  hypothetical protein  34.76 
 
 		 253 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12247  transmembrane protein  39.6 
 
 		 250 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3078  hypothetical protein  37.56 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0234116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2110  hypothetical protein  36.32 
 
 		 245 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0782163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0990  putative integral membrane protein  33.96 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0153454  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13380  hypothetical protein  34.12 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.698481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1857  integral membrane protein  35.62 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1603  integral membrane protein  34.3 
 
 		 254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0287365  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15390  hypothetical protein  36.76 
 
 		 248 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.920438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2036  hypothetical protein  35.47 
 
 		 241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.762589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1597  integral membrane protein  35.27 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000148596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1482  hypothetical protein  32.89 
 
 		 239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.354113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3289  integral membrane protein  35.24 
 
 		 243 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16480  hypothetical protein  32.2 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.693416  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16390  hypothetical protein  30.43 
 
 		 257 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185434  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0827  hypothetical protein  27.46 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  34 
 
 		 2851 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>