22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1273 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1273  hypothetical protein  100 
 
 
591 aa  1160    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722393  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3471  hypothetical protein  60.79 
 
 
642 aa  636    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.515969  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6511  hypothetical protein  36.03 
 
 
587 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0955  hypothetical protein  33.97 
 
 
588 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0947  hypothetical protein  33.51 
 
 
588 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0965  hypothetical protein  33.51 
 
 
588 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4772  hypothetical protein  29.81 
 
 
584 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.389594  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1680  hypothetical protein  32.45 
 
 
618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5256  hypothetical protein  33.62 
 
 
612 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2950  hypothetical protein  28.87 
 
 
596 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3208  hypothetical protein  28.96 
 
 
624 aa  164  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.715837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2908  hypothetical protein  31.02 
 
 
617 aa  153  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0752  hypothetical protein  30.55 
 
 
647 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0456  hypothetical protein  34.51 
 
 
604 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0838  hypothetical protein  25.26 
 
 
585 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.351988  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4224  hypothetical protein  28.73 
 
 
566 aa  120  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0992  hypothetical protein  25.05 
 
 
585 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0769  hypothetical protein  32.46 
 
 
619 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1559  hypothetical protein  25.96 
 
 
716 aa  90.1  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3020  hypothetical protein  30.77 
 
 
641 aa  79.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0195  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
925 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.39307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1066  hypothetical protein  30.51 
 
 
572 aa  57  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>