22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0055 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 395 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  60.87 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  50.79 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  49.85 
 
 		 381 aa  312  7.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  44.81 
 
 		 420 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  45.45 
 
 		 412 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  44.71 
 
 		 358 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  44.85 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  45.14 
 
 		 436 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  45.45 
 
 		 408 aa  222  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  44.21 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  43.28 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  42.55 
 
 		 242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  32.52 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  50.43 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  34.1 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  29.96 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  24.55 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  29.01 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  23.82 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  25.23 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  29.05 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>