22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4532 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  100 
 
 		 884 aa  1736    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  50.08 
 
 		 919 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  28.65 
 
 		 706 aa  189  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  27.87 
 
 		 835 aa  154  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  28.26 
 
 		 713 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  27.57 
 
 		 751 aa  119  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  27.51 
 
 		 814 aa  118  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  31.04 
 
 		 820 aa  110  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  26.97 
 
 		 764 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  28.05 
 
 		 870 aa  102  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  26.08 
 
 		 706 aa  90.1  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  25.68 
 
 		 873 aa  84.7  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  27.5 
 
 		 717 aa  71.2  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  24.17 
 
 		 820 aa  65.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  29.68 
 
 		 784 aa  59.7  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  24.64 
 
 		 728 aa  52.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  25 
 
 		 718 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  28.04 
 
 		 809 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  28.04 
 
 		 809 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  28.04 
 
 		 809 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  30.91 
 
 		 831 aa  48.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  23.59 
 
 		 804 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>