15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4171 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4171  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 85 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1927  phosphopantetheine-binding  58.54 
 
 		 86 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3968  phosphopantetheine-binding  55.84 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0123563  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2061  Acyl transferase  33.33 
 
 		 1420 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206249  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  29.73 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0451  Acyl carrier protein  33.33 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  29.73 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  30.56 
 
 		 77 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  27.63 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4184  hypothetical protein  33.72 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  32.2 
 
 		 81 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  32 
 
 		 84 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>