18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3997 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  65.14 
 
 		 358 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  64.57 
 
 		 412 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  52.48 
 
 		 381 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  48.91 
 
 		 436 aa  138  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  43.72 
 
 		 405 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  50 
 
 		 420 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  44.09 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  40.54 
 
 		 399 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  42.86 
 
 		 390 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  42.55 
 
 		 395 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  48.78 
 
 		 412 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  41.61 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  39.33 
 
 		 367 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  35.4 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  34.48 
 
 		 409 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  32.89 
 
 		 491 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  38.71 
 
 		 466 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>