21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3531 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  845    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  53.38 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  45.39 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  46.76 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  47.41 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  46.62 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  42.54 
 
 		 358 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  46.55 
 
 		 390 aa  90.1  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  53.91 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  41.61 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  41.98 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  44.25 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  45.69 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  50.43 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  34.21 
 
 		 491 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  34.48 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0605  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  57.89 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  25.95 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1335  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  58.33 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  34.78 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  35.59 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>