22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3471 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1273  hypothetical protein  60.84 
 
 		 591 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722393  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3471  hypothetical protein  100 
 
 		 642 aa  1257    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.515969  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0955  hypothetical protein  32.99 
 
 		 588 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0947  hypothetical protein  31.67 
 
 		 588 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0965  hypothetical protein  31.67 
 
 		 588 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6511  hypothetical protein  33.05 
 
 		 587 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4772  hypothetical protein  30.13 
 
 		 584 aa  220  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.389594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1680  hypothetical protein  30.07 
 
 		 618 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5256  hypothetical protein  30.76 
 
 		 612 aa  203  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2950  hypothetical protein  27.87 
 
 		 596 aa  200  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3208  hypothetical protein  29.9 
 
 		 624 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.715837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0752  hypothetical protein  30.9 
 
 		 647 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2908  hypothetical protein  28.29 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4224  hypothetical protein  28.89 
 
 		 566 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0838  hypothetical protein  24.32 
 
 		 585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.351988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0456  hypothetical protein  31.3 
 
 		 604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0992  hypothetical protein  24.61 
 
 		 585 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0769  hypothetical protein  31.39 
 
 		 619 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3020  hypothetical protein  28.46 
 
 		 641 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216512  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1559  hypothetical protein  23.71 
 
 		 716 aa  88.6  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0195  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 		 925 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.39307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1066  hypothetical protein  37.35 
 
 		 572 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>