22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3314 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  51.48 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  52.68 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  48.63 
 
 		 420 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  49.85 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  46.65 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  45.63 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  44.62 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  47.06 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  43.24 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  45.22 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  48.47 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  52.48 
 
 		 242 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  32.56 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  48.06 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  30 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  28.18 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  27.11 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  25.59 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  28.24 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  29.26 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  24.4 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>