23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1822 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  792    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  54.03 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  47.26 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  46.23 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  45.22 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  45.55 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  46.54 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  46.54 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  45.79 
 
 		 390 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  43.81 
 
 		 399 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  45.05 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  42.36 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  44.09 
 
 		 242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  33.24 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  53.91 
 
 		 427 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  31.01 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  32.3 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  30.24 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  27.84 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  22.86 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  29.86 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  28.22 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3397  Lanthionine synthetase C family protein  22.5 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.741439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>