23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1126 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  100 
 
 		 405 aa  797    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  52.08 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  49.76 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  53.44 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  47.33 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  51.06 
 
 		 395 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  45.71 
 
 		 399 aa  269  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  47.73 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  44.74 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  44 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  46.23 
 
 		 408 aa  235  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  44.98 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  44.26 
 
 		 242 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  36.61 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  46.21 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  32.34 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  29.08 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  29.3 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  25.49 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  29.79 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  29.09 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  24.74 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0598  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 864 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>