21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1084 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 671 aa  1318    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0110678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0489  hypothetical protein  57.84 
 
 		 540 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0248447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3977  hypothetical protein  49.11 
 
 		 565 aa  469  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1493  hypothetical protein  48.38 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.22386  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03692  hypothetical protein  43.5 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.274894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0540  hypothetical protein  38.86 
 
 		 532 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2800  hypothetical protein  31.47 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2869  hypothetical protein  31.21 
 
 		 545 aa  203  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3863  hypothetical protein  32.91 
 
 		 530 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0170  hypothetical protein  28.42 
 
 		 517 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1178  hypothetical protein  23.97 
 
 		 496 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0629  hypothetical protein  26.78 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2248  hypothetical protein  23.12 
 
 		 495 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000920075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0300  hypothetical protein  20.22 
 
 		 498 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0247  hypothetical protein  21.58 
 
 		 487 aa  83.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2614  hypothetical protein  33.92 
 
 		 509 aa  77  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000491274  normal  0.0136523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5502  hypothetical protein  31.37 
 
 		 529 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000845668  decreased coverage  0.000369985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1999  hypothetical protein  31.47 
 
 		 136 aa  68.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.588181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2033  hypothetical protein  21.6 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0871  hypothetical protein  27.16 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0380  hypothetical protein  31.39 
 
 		 540 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>