14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1065 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1065  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390948  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  66.08 
 
 
287 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2065  hypothetical protein  64.26 
 
 
280 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.379601  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  63.54 
 
 
280 aa  363  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  61.57 
 
 
289 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  60.34 
 
 
343 aa  351  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2883  hypothetical protein  46.21 
 
 
310 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  44.64 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  43.93 
 
 
293 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  36.6 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  34.47 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  32.95 
 
 
265 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43168  predicted protein  28.62 
 
 
282 aa  97.4  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  23.98 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>